O Centro da Biomassa para a Energia tem como principal finalidade a valorização da biomassa através da otimização e conhecimento das suas várias cadeias de valor, contribuindo para a melhoria da gestão integrada de recursos, prevenção dos fogos rurais e transição energética. O âmbito de actividade do CBE é o da biomassa para fins energéticos, compreendendo todas as formas disponíveis, cooperando em estreita ligação com as empresas e outros organismos e departamentos de investigação nacionais e estrangeiros.

A base de atividade da Unidade de Biomassa é o estudo das fileiras de valorização energética da biomassa de origem florestal; agrícola; resíduos sólidos da atividade agroindustrial e da indústria transformadora da madeira; resíduos de origem animal; resíduos urbanos e espécies especialmente vocacionadas para a produção de energia.